Ancienne abbaye bénédictine, elle constituera longtemps une des plus importantes de Franche-Comté. Église, résidence de l’abbé, cours avec fontaine…témoignent encore d’une implantation monastique importante. l’abbaye a conservé l’essentiel de ses bâtiments et des recherches dans le chœur de l’église abbatiale montrent l’existence de constructions antérieures à 869, date à laquelle l’abbaye apparaît dans les textes. Baume prospère et s’agrandit tout au long du XIe siècle pour accueillir une importante communauté monastique. En 1759, l’abbaye, sécularisée, devient Baume-les-Messieurs et les derniers moines la quittent en 1790.